mardi 8 octobre 2013

III - La génétique - le cas Family Tree DNA (FTDNA) (1er volet)


FTDNA ET LES PRODUITS PROPOSÉS

VOLET I

Bienvenue sur le 1er volet d'une série qui en compte 3 :
  1. FTDNA et les produits proposés
  2. Les outils mis à disposition
  3. Les résultats obtenus
FamilyTreeDNA (FTDNA) est une compagnie américaine ayant beaucoup de succès notamment dans les pays nord américains et en Europe mais dans une moindre mesure à l'exception de l'Irlande et le Royaume-Uni.

En date du 8 octobre 2013 et avec plus de 653 821 personnes génétiquement testés, FTDNA compte parmis les leader mondiaux sur le marché, il va sans dire que leur nombre est croissant, et ce n'est que le "pré-commencement". Ça me rappelle quand Facebook est arrivé, "jamais j'irais la-dessus c'est trop impersonnel...", aujourd'hui c'est plus d'un milliard de Facebookeurs et plus d'un milliard de contenu posté au quotidien et 4,5 milliards de like...! 

Devant la diversité des possibilités des tests ADN et des résultats produits, FTDNA s'affiche comme une compagnie performante cependant, comme toutes les compagnies, le renouvellement et les découvertes sont importants pour éviter le vieillissement et se faire rattraper, voir dépasser par des nouvelles compagnies prêtes à relever le défi qu'est la génétique aujourd'hui et celle de demain.

Il faut aussi prendre en considération que le nombre de francophones testés reste relativement bas, je dirais au bas mot, moins de 2000 personnes testées chaque année et encore je pense que je suis large alors que nos cousins celtes ont vu leur nombre de tests explosé.

Voyons en détail les possibilités offertes par FTDNA selon mon expérience et ce que l'on y apprend. Encore une fois, c'est tout en anglais, et oui, les compagnies américaines oublient très souvent que "l'américain" n'est pas la langue du monde... Je vous ai mis une traduction Google Chrome qui vous simplifiera grandement la tache avec quelques modifications pour rendre la lecture en français de façon plus agréable...

Je voudrais souligner une fois de plus que je ne suis pas payé par une société commerciale et les tests, je les fais TOUT SEUL.


Sur la vitrine en ligne de FTDNA, 3 tests sont proposés, cependant, ce n'est qu'une façade car évidemment il y a bien d'autres tests, mais il faut bien regarder ce qui se pratique et ce qu'il ne faut pas commander.

Ha oui petite précision, c'est tout en dollars... Donc Google ou tout autre utilitaire vous aidera à la conversion.

Bon alors on fait quoi la-dessus, on commande quoi, on nous dit quoi, on y voit quoi ??

Avant de commander

Avant de se jeter sur n'importe quoi, il convient de clarifier pourquoi vous voulez le faire, ce que ça va coûter suivant ce que vous recherchez, et que vous allez devoir être PATIENT !!

Je vous conseille de lire avant toute chose cet article sur l'ADN en question pour vous éclairer davantage.

Selon que vous soyez une femme ou un homme à son importance, pas besoin de vous expliquez que, biologiquement parlant, nous sommes différents.

Vous pouvez chercher si toutefois votre nom de famille fait l'objet d'une étude, c'est par là que tout peut commencer...

Rechercher Votre nom de famille
 

Résultats de la recherche un nom de famille

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LE GALL5

Nom de famille matchs de projet

Il y a un projet de patrimoine associé à votre nom, et nous vous recommandons de le rejoindre! En se joignant à votre projet de nom de famille, vous serez en mesure de vérifier si vous vous connectez à l'une des lignes existantes.
Cliquez sur le nom pour plus de détails d'un projet ou d'adhérer au projet.
PROJETS
ProjectMembresDescription
Le Gall4Version Française J'ai commencer r.é. Groupe dans Le Québec, mais l ...
Votre nom n'y est pas ? Tant mieux, vous allez être le/la pionnier(e) pour créer votre nom de famille sur FTDNA et peut-être avec le temps trouver des gens qui ont un ancêtre commun ! Et oui car après, c'est une histoire de temps à plusieurs niveaux, temps d'attente pour "matcher" quelqu'un, temps ancestral non répertorié sur votre arbre...

Mais bon ceci dit, vous n'êtes pas obligé de passer par la pour vous faire des milliers de cousins, mais vous pouvez dénicher le pompon avec quelqu'un de proche dont vous ne soupçonneriez pas son existence.

L'idéal c'est quand même d'avoir fait son arbre généalogique pour partager et comprendre d'où part notre ancêtre commun, si toutefois l'arbre le permet ! Si vous n'avez pas d'arbre, et que vous ne savez rien de votre famille, c'est au petit bonheur la chance que de trouver un membre de famille proche, mais pas impossible.

Avant de vous lancer définitivement dans une commande, je vous conseille de discuter avec des gens qui l'ont fait, de lire quelques forums voir ce qu'il se dit afin de vous imprégner de cette généalogie d'un nouveau genre. 

Si avant on vous comparait a un rat de bibliothèque ou une rongeuse de documents anciens, ne croyez pas que vous allez devenir un rat de laboratoire ou une rongeuse génétique !! Non, non et non !

Face aux réseaux sociaux croissants, la généalogie s'est installée au coeur même de la technologie 2.0 pour devenir avec la génétique un puissant moteur de recherche et ça, les entreprises de séquence génétique l'ont bien compris...


Faire son choix

Sur cette page, vous allez avoir accès à tout type de test et sur cette page c'est bien clairement expliqué.


Attention, les prix peuvent varier au moment où  je vais publier cet article, donc vérifier bien (il y a des promotions des fois). 

Pour les hommes

Quels tests sont disponibles pour vous?

 
Cliquez sur "Plus d'infos ..." ci-dessous le nom de chaque test pour une description. Version imprimable contenant toutes les descriptions d'essai
TESTS COMBINÉ POUR LIneage hommes ET FEMmes - POUR LA GÉNÉALOGIE ET L'ANTHROPOLOGIE
Family Finder + Y-DNA12
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ORDER NOW
Finder famille + Y-dna67
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Y-DNA67 + mtFullSequence
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Y-DNA37 + mtDNAPlus
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Finder famille + Y-DNA37
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Family Finder + mtDNAPlus
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Family Finder + mtFullSequence
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ORDER NOW
vY-DNA37 + mtFullSequence
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autre compagnie tierce pour le transfert
Autosomique transfert d'ADN
Plus d'infos ...
Transfert Y-DNA33
Plus d'infos ...
Transfert Y-DNA33 + Y-DNA25
Plus d'infos ...
Transfert Y-DNA46
Plus d'infos ...
Transfert Y-DNA46 + Y-DNA37
Plus d'infos ...
SERVICES de tests SPÉCIALISÉS
  • tests de germanité nécessitent des conseils et des conseils professionnels, veuillez contacter notre spécialiste de la germanité aujourd'hui pour un devis personnalisé.
  • Pour les extractions d'ADN à partir d'échantillons autres que les cellules de la joue.
  • Soumettez votre demande par mail pour un devis.
* Les tests d'ADN autosomique Tests X-STR seuls ne fournissent pas un rapport complet. Si vous avez besoin d'un rapport des administrateurs complet, avec interprétation s'il vous plaît écrivez-nous pour un devis.

Et pour les Femmes

Quels tests sont disponibles pour vous?

 
Cliquez sur "Plus d'infos ..." ci-dessous le nom de chaque test pour une description. Version imprimable contenant toutes les descriptions d'essai
TESTS COMBINÉ POUR LIneage hommes et femmes - POUR LA GÉNÉALOGIE ET L'ANTHROPOLOGIE
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SERVICES de tests SPÉCIALISÉS
  • tests de germanité nécessitent des conseils et des conseils professionnels, veuillez contacter notre spécialiste de la germanité aujourd'hui pour un devis personnalisé.
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* Les tests d'ADN autosomique Tests X-STR seuls ne fournissent pas un rapport complet. Si vous avez besoin d'un rapport des administrateurs complet, avec interprétation s'il vous plaît écrivez-nous pour un devis.
Vous avez parcouru en détail ce que propose FTDNA ? Très bien, maintenant je commande quoi ? Encore une fois, tout dépend de ce que vous voulez savoir.

Ce qu'il ne faut pas commander :

Le produit ci-dessous est 
à exclure. En effet, si vous envisagiez de faire des tests SNP, ce type de test est complètement obsolète. FTDNA à fait un partenariat avec Genographic Project (voir dans cet article) qui donne les informations complètes de son haplogroupe Y et X DNA.

Ça y est, vous êtes décidé et vous allez passer commande ? Alors sachez que le kit vous sera expédié un mercredi (c'est toujours comme ça) et qu'il faut compter 1 semaine pour le recevoir et le même temps pour le renvoyer.

Je vous déconseille d'attendre plusieurs jours pour renvoyer le kit, c'est maintenant ou jamais, et éviter de faire votre test après avoir mangé ou après avoir bu du jus d'orange... enfin bref, faites le dans des conditions normales et avec des mains propres...


Quand votre kit aura été reçu par FTDNA, il faudra compter environ 5/6 semaines pour avoir vos résultats, dans certains cas c'est plus long, ça arrive, lorsque votre résultat n'ont pas passé les contrôles qualité, FTDNA refait le test avec le reste de votre salive qu'ils ont leur disposition.

Vous avez commencé à recevoir vos premiers résultats, et vous n'y comprenez rien ? Heureusement, il y a des communauté d'administrateurs de groupes, de forums, de sites internet, des pages Facebook, des groupes Yahoo!, etc.. qui peuvent aider à comprendre les mécanismes, mais c'est bien souvent en anglais...


Le prochain volet traitera des outils mis à disposition ce qui vous aidera à voir un peu plus clair dans l'approche des résultats obtenus et comment à partir de l'approche génétique, la généalogie peut entrer en jeu.

jeudi 3 octobre 2013

II - La génétique - le cas Genographic Project

Lorsque j'ai reçu les résultats de Genographic Project pour la première fois début mars 2013,  j'avoue avoir été agréablement surpris par le niveau de détail des informations.

Voyons comment cela se présente.

A première vue, c'est beau et agréable a lire (encore une fois, c'est tout en anglais... Je vous ai mis la version traduite de Google Chrome pour vous simplifier la lecture).

Ma lignée maternelle affiche M4"67 qui est parent de M30 (affiché sur 23andMe) dont l'origine est Asie du Sud. La ligne serait donc L3>M>M4"67>M30.

Ma lignée paternelle affiche R-Z253 qui est enfant de L21 (affiché sur 23andMe) dont l'origine est classée Irlandais de type 4 - Type continental, on en reparlera dans un autre sujet.



Présentation de la lignée maternelle (quelques vues seulement).

La navigation est aisée et compréhensible. Les informations vous sont données au fur et a mesure que vous progressez avec la carte et la descriptions des haplogroupes est réaliste.






Présentation de la lignée paternelle 

C'est très bien documenté, environ une douzaine de pages expliquant les origines de l'haplogroupe.



La fonction "Who am I ?" (Qui suis-je) permet de connaître a partir de l'ensemble du génome la composition ancestrale géographique.

Les résultats sont données en fonction de 9 régions basées sur des modèles spécifiques de ces régions. Ainsi, l'Asie du Nord, la Méditerranée, l'Afrique Australe, Sud-Ouest Asiatique, Native Américain, Océanie, Asie du Sud, Europe du Nord et Afrique Subsaharienne.




Ensuite, on apprend quelles sont les populations de référence qui se rapprochent le plus de  notre génome.

La première population de référence me concernant est britannique (Royaume-Uni). 


Puis la seconde référence de population. En toute franchise j'y ait moins cru, mais pourquoi pas. Dans certains forums anglophones, la plupart des gens en ressortent avec cette référence de population et ne sont pas convaincus non plus, je pense qu'un affinage est nécessaire.

J'ai quand même demandé a Genographic Project des explications pour comprendre, qui d'ailleurs ne m'a pas convaincu non plus.

Leur réponse : "Merci d'avoir pris contact avec Genographic Project. Votre "Qui je suis ?" révèle souvent de nouvelles informations que nous n'avions pas connaissance a propos de nos ancêtres. Par exemple, vos ancêtres pourraient avoir émigré d'un endroit a un autre, comme par exemple La Manche était un moyen naturel de transport entre l'Angleterre et le reste de l'Europe. Ces résultats sont obtenus en comparant votre ADN aux populations de référence que nous avons dans notre base de données, et vos populations de référence sont le résultat de cette comparaison.

"Thank you for contacting the Genographic Project. Your "Who Am I?" results can often reveal new information that we previously did not know about our ancestors. For example, your ancestors may have migrated from one place to another, as the English Channel was a natural means of transportation between England and the rest of Europe. These results are obtained by comparing your DNA to reference populations that we have in our database, and your reference populations are the result of this comparison."




Et enfin, le pourcentage que révèle votre génome en fonction de nos ancêtres hominidés. En cliquant sur "en savoir plus", il est expliqué ce que cela signifie.



La section "Our Story" (Notre Histoire) indique comment les testés sont génétiquement proches de vous.


Lignée maternelle

Ci-dessous la représentation des personnes qui partagent mes marqueurs génétiques coté maternel. Plus les points sont proches du centre, plus ils sont génétiquement similaires. 

Chaque participant peut laisser un commentaire, c'est pas obligatoire, mais ça peut aider a créer des liens que vous n'auriez pas imaginer.



Lignée paternelle

Dans l'exemple ci-dessous, on voit nettement le nombre de personnes qui ont en commun mes marqueurs génétiques.

Cependant, il convient de ne pas confondre sur le fait que toutes ces personnes ne sont pas des frères et des soeurs, ni des oncles, etc... Proche génétiquement ne signifie pas être de la même famille, mais pourrait éventuellement partager un ancêtre en commun a une certaine époque plus ou moins lointaine.

Vous avez la possibilité de parcourir les histoires des gens qui souhaitent publiquement mettre un mot.


Pour aller plus loin

Une option "expert" vous est proposé si toutefois vous désirez poursuivre l'aventure un peu plus loin. En effet vous avez la possibilité de transférer gratuitement vos données sur un site qui se nomme Family Tree DNA, dont le but est de rechercher de la famille proche et de partout dans le monde, de comprendre ses origines... J'en parlerais plus en détail dans un autre sujet bientôt.

mercredi 2 octobre 2013

I - La génétique - le cas 23andMe

Le premier test génétique a été fait avec 23andMe fin 2011, une compagnie américaine dont elle promeut 2 types de test, l'un médical et l'autre votre ascendance ancestrale.


Ascendance ancestrale vous avez dit ?

Les tests sont basés sur 23 paires de chromosomes et vous donnent une analyse personnalisée de vos origines ancestrales. Pourquoi pas, après tout, je suis bloqué dans mon arbre généalogique en 1605 et il y a 99,9% de chance que je n'aille pas plus loin.

Grâce a ce test, je vais pouvoir découvrir l'origine de mes ancêtres (si toutefois il n'y a pas eu d'événements familiaux - par exemple une adoption...). Mais rien est sur, il faudrait imaginer que tout se soit passé normalement, mais si vous regardez l'histoire de France, vous comprendrez que certains événements ont pu entraver les familles a certaines époques.


Comment ça marche ?

La technique est simple, vous commandez sur leur site web (en anglais) et il faut compter 1 semaine pour recevoir le kit. Et environ 1 semaine pour le renvoyer, et enfin environ 4/5 semaines pour recevoir les informations sur leur site.


Euh... combien ça coûte ?

Le prix est de... 99$ (soit ± 73 €).


Voyons les résultats...

Je vous conseille d'installer Google Chrome si vous n'êtes pas un as de l'anglais... Pour ma part je vous l'ai mis en français autrement je suis bilingue.

La composition ancestrale illustrée ci-dessous correspond a une estimation spéculative. En effet il existe 3 niveaux d'estimation, Spéculative (50%), Standard (75%), et Prudente (90%).

Dans mon cas, j'ai pris en considération l'estimation spéculative qui représente au mieux ma composition ancestrale suivant mon arbre généalogique.

Sans surprise, les premiers résultats indiquent 100% Européen, c'est en somme toute logique. Cependant, la surprise est davantage du coté Britannique et Irlandais (16%) qui n'était pas prévue du tout et encore moins le coté Ashkenaze (3.7%)

Ma lignée paternelle est bretonne depuis plus de 400 ans, et ma lignée maternelle est partagée entre l'Italie, la France et très certainement l'Allemagne. Cette composition précise tend a disparaitre pour devenir davantage plus floue géographiquement parlant, avec des pourcentages amoindris si l'on choisit une estimation standard voir prudente.

En changeant les niveaux d'estimation, cela change aussi le pourcentage affecté a chaque résolution en fonction du niveau de confidence de l'analyse.

Davantage d'information en vous rendant ici, cependant c'est en anglais mais a ce stade vous avez déjà Google Chrome ;-)


Une fonction avancée très innovante est la répartition parentale de votre adn, mais cela dépend si votre père ou mère a également fait le test, si ce n'est pas le cas cette fonction sera indisponible.
Composition chromosomique

La composition chromosomique est intéressante puisqu'elle indique votre composition ancestrale selon les régions parmi les 22 chromosomes + le chromosome X.


A propos de ma lignée paternelle

L'Haplogroupe R1b1b2a1a2f est le nom donné a ma classification génétique et est représenté sur la carte ci-dessous.

En fait, le nom exact est R1b1a2a1a2c - L21/M529/S145, L459, Z290. En effet, devant l'augmentation croissante des découvertes, 23andMe utilise toujours une ancienne table qui date de plus de 3 ans, ce qui peut prêter a confusion lors de discussion sur des forums si l'on est pas au courant.

Le groupe L21 est une branche celtique atlantique - il y a davantage d'information sur Eupedia.

Bien plus tard, L21 mettra en évidence bien plus qu'un groupe génétique, et révélera mon sous-groupe "Irlandais de type 4 - Type continental"... qui sera détaillé très prochainement.



A propos de ma lignée maternelle

L'Haplogroupe M30 est le nom donné a ma classification génétique et est représenté sur la carte ci-dessous.

En toute franchise, j'ai un doute sur cette classification me concernant et n'ayant aucun trait physique me rapprochant de la catégorie de population mentionnée ci-dessous. Cependant, a prendre avec prudence.

Et a ce jour, aucune comparaison possible avec quelqu'un de ce même groupe, n'ayant trouvé personne avec un quelconque patrimoine génétique du même ordre.


  • Haplogroupe : M, un sous-groupe de L3
  • Âge : 60000 ans
  • Région : Asie
  • Exemple de Population : Indiens, les Chinois, les Tibétains
  • Point important : Haplogroupe M s'est propagé de l'Afrique à l'Asie du sud-est pendant quelques millénaires.